آنالیز متیلاسیون DNA در سراسر ژنوم و تغییر بیان ژن در سرطان ریه

قیمت: 40,000 تومان

دانلود رایگان مقاله

خرید ترجمه مقاله

عنوان فارسی

آنالیز متیلاسیون DNA در سراسر ژنوم و تغییر بیان ژن در سرطان ریه

عنوان لاتین

Genome-Wide Analysis of DNA Methylation and the Gene Expression Change in Lung Cancer

مقدمه: مطالعات اخیر متیلاسیون DNA راجع به سرطان ها، ضرورت تهیه پروفایل یک ژنوم کامل انسان را آشکار نموده و تهیه پروفایل را به مناطق ویژه ای از ژنوم انسان محدود نمی سازد. نشان داده شده است که آنالیز متیلاسیون DNA در سراسر ژنوم ما را قادر به شناسایی ژن هایی می سازد که بوسیله متیلاسیون در سرطان زایی تنظیم می شوند. متدها: بنابراین، ما آنالیز متیلاسیون DNA را برای کارسینومای سلول سنگ فرشی (SCC) که قویا مرتبط با کشیدن سیگار می باشد، انجام دادیم. ما همچنین، ریزآرایه را با استفاده از 21 جفت از بافت های طبیعی ریه و تومورهایی از بیماران مبتلا به SCC انجام دادیم. با ترکیب این اطلاعات، 30 ژن هایپرمتیله شده و با تنظیم منفی و 22 ژن هیپومتیله شده و با تنظیم مثبت انتخاب شدند. سطح بیان ژن و الگوی متیلاسیون DNA به ترتیب بوسیله واکنش زنجیره ای پلی مراز رونوشت بردار معکوس نیمه کمی و توالی یابی پایرو تایید شدند. یافته ها: بوسیله این تاییدها، ما پنج ژن هایپرمتیله شده و با تنظیم منفی و یک ژن هیپومتیله و با تنظیم مثبت را انتخاب کردیم. بعلاوه، این موضوع که این 6 ژن در حقیقت بوسیله متیلاسیون DNA تنظیم می شوند بوسیله تایید بازیابی الگوی متیلاسیون DNA و سطح بیان ژن با استفاده از یک عامل دمتیله کننده، اثبات گردید. الگوی متیلاسیون DNA ناحیه پروموتری CYTL1 بصورت قابل توجهی میان مراحل اولیه و پیشرفته از SCC متفاوت بود. نتیجه گیری: بعنوان نتیجه، بوسیله ترکیب الگوی متیلاسیون DNA و پروفایل بیان ژن، ما 6 ژنی را که بوسیله متیلاسیون DNA تنظیم می شوند (CCDC37، CYTL1، CDO1، SLIT2، LMO3 و SERPINB5) را شناسایی نمودیم و ارزش آن ها را بعنوان مولکول های هدف برای مطالعه بیشتر SCC نشان دادیم.

Introduction: The recent DNA methylation studies on cancers have revealed the necessity of profiling an entire human genome and not to restrict the profiling to specific regions of the human genome. It has been suggested that genome-wide DNA methylation analysis enables us to identify the genes that are regulated by DNA methylation in carcinogenesis. Methods: So, we performed whole-genome DNA methylation analysis for human lung squamous cell carcinoma (SCC), which is strongly related with smoking. We also performed microarrays using 21 pairs of normal lung tissues and tumors from patients with SCC. By combining these data, 30 hypermethylated and down-regulated genes, and 22 hypomethylated and up-regulated genes were selected. The gene expression level and DNA methylation pattern were confirmed by semiquantitative reverse-transcriptase polymerase chain reaction and pyrosequencing, respectively. Results: By these validations, we selected five hypermethylated and down-regulated genes and one hypomethylated and up-regulated gene. Moreover, these six genes were proven to be actually regulated by DNA methylation by confirming the recovery of their DNA methylation pattern and gene expression level using a demethylating agent. The DNA methylation pattern of the CYTL1 promoter region was significantly different between early and advanced stages of SCC. Conclusion: In conclusion, by combining the whole-genome DNA methylation pattern and the gene expression profile, we identified the six genes (CCDC37, CYTL1, CDO1, SLIT2, LMO3, and SERPINB5) that are regulated by DNA methylation, and we suggest their value as target molecules for further study of SCC.