ساختار ثانویه، سنگواره ها و تاریخ ملکولی در شجره نامه هزار پایان

قیمت: 39,000 تومان

دانلود رایگان مقاله

خرید ترجمه مقاله

عنوان فارسی

ساختار ثانویه، سنگواره ها و تاریخ ملکولی در شجره نامه هزار پایان

عنوان لاتین

Including secondary structure, fossils and molecular dating in the centipede tree of life

یک طرح مورفولوژیکی ارتباط بین هزارپایان، که زمانی به صورت گسترده ای پذیرفته شده بود، در تضاد با داده های ملکولی با توجه به رویدادهای اشتقاق عمیق می باشد. پوشش رده بندی بسط یافته با تحلیل های پیشین قطعات بلندتری از 28S rRNA و ترازبندی ساختاری را بعنوان بخشی از نمونه چهار ژن برای 111 گونه موجود مقایسه شدند. این داده های توالی با مورفولوژی تحت شرایط سخت و ماکزیمم احتمالات ترکیب شده و ترازبندی توالی متعدد سنتی و روش های بهینه سازی مستقیم را مورد کاوش قرار داده اند. روش های جدید برای ترکیب کردن اطلاعات ساختار ثانویه نیز مورد بررسی قرار گرفته اند. داده های ملکولی در درخت راندمان ترکیب قرار گرفته و با مورفولوژی با توجه به مونوفیلی همه دسته های هزارپا علاوه بر گروه های اصلی در هر دسته بندی بزرگ همنهشت هستند. بدون توجه به شاخص بهینه یا استراتژی ترازبندی، Craterostigmomorpha تاسمانی/زلاندنو در موقعیت های متفاوت براساس داده های ملکولی به جای مورفولوژی تفکیک شدند. مورفولوژی علاوه بر اینکه موقعیت Craterostigmomorpha را واژگون می کند و نیاز به واژگونی های اصلی خصوصیات با توجه به شرایط رشد و مراقبت های مادری حذف می گردد. کالیبراسیون درخت با سنگواره های پالائوزوئیک و مزوزوئیک برای تحلیل ساعت استراحت با سیگنال دیرین شناسیدر تطابق می باشد که بین رده بندی های هزارپایان با Silurian و Devonian اولیه واگرایی را نشان داده و این واگرایی های خانوادگی به صورت کلی به دوره پالازوئیک بازمی گردد.

A well-corroborated morphological scheme of interrelationships for centipedes, once broadly accepted, has been in conflict with molecular data with respect to deep branching events. Expanded taxonomic coverage compared to previous analyses adds longer fragments for 28S rRNA and a structural alignment as part of a sample of four genes (two nuclear ribosomal and two mitochondrial) for 111 extant species; these sequence data are combined with morphology under parsimony and maximum likelihood, exploring both traditional multiple sequence alignment and direct optimization approaches. Novel automated procedures to incorporate secondary structure information are also explored. The molecular data in combination yield trees that are highly congruent with morphology as regards the monophyly of all centipede orders as well as the major groups within each of the large orders. Regardless of the optimality criterion or alignment strategy, the Tasmanian/New Zealand Craterostigmomorpha is resolved in a different position by the molecular data than by morphology. Addition of morphology overturns the placement of Craterostigmomorpha in favour of the traditional morphological resolution and eliminates the need to posit major character reversals with respect to developmental mode and maternal care. Calibration of the tree with Palaeozoic and Mesozoic fossils for a relaxed clock analysis corroborates the palaeontological signal that divergences between centipede orders date to the Silurian and earliest Devonian, and familial divergences are likewise almost wholly Palaeozoic